RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 PIGFQ07326 219 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 PUDPQ08623 228 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CAMK2DQ13557 499 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SCAIQ8N9R8 606 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SMYD1Q8NB12 490 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6S1Q8NH40 331 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF607Q96SK3 696 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF726A6NNF4 738 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 EVPLLA8MZ36 301 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 M0R3H8 397 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 PLPP3O14495 311 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 LILRA1O75019 489 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 MFN2O95140 757 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 GPX2P18283 190 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 HNF1AP20823 631 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 NR4A1P22736 598 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 AHCYP23526 432 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 IL2RGP31785 369 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 GIPRP48546 466 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CHN2P52757 468 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 SQLEQ14534 574 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 MSMPQ1L6U9 139 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 GSG1Q2KHT4 349 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CR1LQ2VPA4 569 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 HIPK4Q8NE63 616 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 LRR1Q96L50 414 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 SNX18Q96RF0 628 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 MCHR1Q99705 422 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 TPK1Q9H3S4 243 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CMAHPQ9Y471 501 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 GMEB1Q9Y692 573 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf98E9PRG8 122 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 SYNGR3O43761 229 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 OPN1SWP03999 348 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 TACSTD2P09758 323 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 PATE4P0C8F1 98 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ADORA3P0DMS8 318 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNGR1P15260 489 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 THBS2P35442 1172 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CSNK1A1P48729 337 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 BIDP55957 195 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 SELPLGQ14242 412 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIP10Q15642 601 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 NPTX1Q15818 432 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP51A1Q16850 503 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF627Q7L945 461 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 PXKQ7Z7A4 578 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 PTOV1Q86YD1 416 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF786Q8N393 782 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGDIGQ99819 225 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 SYT3Q9BQG1 590 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 FZR1Q9UM11 496 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 M0QX08 132 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 M0R233 179 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CHP2O43745 196 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 FMO6PO60774 539 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6A2O95222 327 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB36O95755 333 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 CH25HO95992 272 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 MT-ATP6P00846 226 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF35P13682 527 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms