RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 CAPZA2P47755 286 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-204ENST00000446285 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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ODC1-204ENST00000446285 KLF10Q13118 480 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-204ENST00000446285 PHYHD1Q5SRE7 291 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-204ENST00000446285 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-204ENST00000446285 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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ODC1-204ENST00000446285 OR4D11Q8NGI4 311 aa23.17■■□□□ 1.3
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ODC1-204ENST00000446285 C10orf105Q8TEF2 133 aa23.16■■□□□ 1.3
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ODC1-204ENST00000446285 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 FAM220BPB1ANY3 271 aa23.11■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 HLA-HP01893 362 aa23.11■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 THRBP10828 461 aa23.11■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 UMPSP11172 480 aa23.11■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 CD79AP11912 226 aa23.11■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 B4GALT1P15291 398 aa23.11■■□□□ 1.29
ODC1-204ENST00000446285 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.11■■□□□ 1.29
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