RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	ASB9	Q96DX5	294 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	TRIM15	Q9C019	465 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG11-208	ENST00000437028	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028		B9A039	149 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	MFN2	O95140	757 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	AHSA1	O95433	338 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SERPINF1	P36955	418 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CA10	Q9NS85	328 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LMX1B	O60663	402 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LGI1	O95970	557 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	THBS2	P35442	1172 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SELENOP	P49908	381 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	MS4A2	Q01362	244 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	FLOT2	Q14254	428 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	FXN	Q16595	210 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM166A	Q6J272	317 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	POMP	Q9Y244	141 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028		V9GYQ6	96 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CUBN	O60494	3623 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028		M0R3H8	397 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	NPIPB7	O75200	414 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF43	P17038	809 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	HNF1A	P20823	631 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CD247	P20963	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	P2RY4	P51582	365 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SELENOW	P63302	87 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	DUSP7	Q16829	419 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CBLL1	Q75N03	491 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2T1	O43869	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LY6H	O94772	140 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SRD5A1	P18405	259 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms