RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NANOG	Q9H9S0	305 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R3G1	203 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	HAX1	O00165	279 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CSF3	P09919	207 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ARR3	P36575	388 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINF1	P36955	418 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	HGFAC	Q04756	655 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	EFNB3	Q15768	340 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ADIPOQ	Q15848	244 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF74	Q16587	644 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ5	Q5HYK3	327 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CGB2	Q6NT52	195 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM168A	Q92567	244 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MRGBP	Q9NV56	204 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		15.37	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738		B9A039	149 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC14L2	O76054	403 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	LY6H	O94772	140 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZP4	Q12836	540 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMK2D	Q13557	499 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RABL3	Q5HYI8	236 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CARD17	Q5XLA6	110 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MDP1	Q86V88	176 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PROX1	Q92786	737 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC58	Q96CX6	371 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MPP4	Q96JB8	637 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF75A	Q96N20	296 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PLK3	Q9H4B4	646 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	USP22	Q9UPT9	525 aa		15.36	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	VWC2L	B2RUY7	222 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	LMX1B	O60663	402 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NPPA	P01160	153 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4A8	P0C604	315 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ADORA3	P0DMS8	318 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	AHCY	P23526	432 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	KLF10	Q13118	480 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3GL1	Q99961	368 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SAR1A	Q9NR31	198 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		15.35	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF726	A6NNF4	738 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CH25H	O95992	272 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PPOX	P50336	477 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ARFIP2	P53365	341 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NPRL3	Q12980	569 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	REP15	Q6BDI9	236 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6X1	Q8NH79	312 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM54	Q969K7	222 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXB1	Q99853	325 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NOX3	Q9HBY0	568 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NANS	Q9NR45	359 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FKBP7	Q9Y680	259 aa		15.34	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf98	E9PRG8	122 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-H	P01893	362 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNGR1	P15260	489 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SRD5A1	P18405	259 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	THBS4	P35443	961 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPZA2	P47755	286 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	BID	P55957	195 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	VHLL	Q6RSH7	139 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX32	Q86XE0	403 aa		15.33	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		15.33	■□□□□ 0.04

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