RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 USP22Q9UPT9 525 aa23.59■■□□□ 1.37
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LMO1-202ENST00000428101 HLA-HP01893 362 aa23.58■■□□□ 1.37
LMO1-202ENST00000428101 USF1P22415 310 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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LMO1-202ENST00000428101 MSMPQ1L6U9 139 aa23.52■■□□□ 1.36
LMO1-202ENST00000428101 SNX32Q86XE0 403 aa23.52■■□□□ 1.36
LMO1-202ENST00000428101 OR8J3Q8NGG0 315 aa23.52■■□□□ 1.36
LMO1-202ENST00000428101 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LMO1-202ENST00000428101 TMEM160Q9NX00 188 aa23.52■■□□□ 1.36
LMO1-202ENST00000428101 GLTPQ9NZD2 209 aa23.52■■□□□ 1.36
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