RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GGTLC2Q14390 218 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ACKR1Q16570 336 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SGCBQ16585 318 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 STEAP3Q658P3 488 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A16Q86VW1 577 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6V1Q8N148 313 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR8H2Q8N162 312 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T4Q8NH00 348 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ABHD4Q8TB40 342 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ELP5Q8TE02 316 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB15Q8WXK1 588 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PELI1Q96FA3 418 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MED18Q9BUE0 208 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MROQ9BYG7 248 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 INIPQ9NRY2 104 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NCDNQ9UBB6 729 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LOXL2Q9Y4K0 774 aa3.59□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PMS2P1A4D2B8 440 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 STK17BO94768 372 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TXNDC12O95881 172 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DQA2P01906 255 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TCN2P20062 427 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IL11P20809 199 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 F8A1P23610 371 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EDNRAP25101 427 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CASP3P42574 277 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A1P53007 311 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTA2P62736 377 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTG2P63267 376 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SIRPAP78324 504 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXF1Q12946 379 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IL10RAQ13651 578 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MELKQ14680 651 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OXA1LQ15070 435 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR7A5Q15622 319 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF528Q3MIS6 628 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SDK2Q58EX2 2172 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMAT1Q5H9K5 638 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EMC4Q5J8M3 183 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6N2Q8NGY6 317 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 STK35Q8TDR2 534 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ST8SIA1Q92185 356 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 AP3S1Q92572 193 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NXPE2Q96DL1 559 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TIGARQ9NQ88 270 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PISDQ9UG56 409 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PADI1Q9ULC6 663 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MOKQ9UQ07 419 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 POLHQ9Y253 713 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.59□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FABP12A6NFH5 140 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPP3O14495 311 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CBFA2T3O75081 653 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 JMJD7P0C870 316 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF883P0CG24 379 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 COX6A1P12074 109 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DOBP13765 273 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TGM1P22735 817 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OTX2P32243 289 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ETV6P41212 452 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PTGDSP41222 190 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms