RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADRA2AP08913 450 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPN1P15169 458 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 GP2P55259 537 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NXNL2Q5VZ03 156 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ROBO4Q8WZ75 1007 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RFKQ969G6 155 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 OTULINQ96BN8 352 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASD2Q96D21 266 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 FANCFQ9NPI8 374 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAMK2AQ9UQM7 478 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM183AA6NL82 134 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIIAD1A6NNX1 92 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARPC3O15145 178 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH11P55287 796 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACKR1Q16570 336 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNPY1Q3B7I2 92 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLXDC2Q6UX71 529 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PXKQ7Z7A4 578 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 BBS1Q8NFJ9 593 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM80Q96HE8 168 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDCA4Q9BXL8 241 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRHPRQ9UBQ7 328 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPIPA2E9PIF3 369 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPIPA3F8WFD2 350 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 LY6DQ14210 128 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRF3Q14653 427 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLBD1Q6P4A8 553 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4K13Q8NH42 304 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR137Q96N19 417 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACACBO00763 2458 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 LCKP06239 509 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 APEHP13798 732 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDHAP31040 664 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBE2UQ5VVX9 321 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR107Q5VW38 600 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52E2Q8NGJ4 325 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCGR1BQ92637 280 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNFT2Q96EX2 444 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 OXGR1Q96P68 337 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 TXNIPQ9H3M7 391 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS2R16Q9NYV7 291 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASD1Q9Y272 281 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PRG6 482 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 IDH3BO43837 385 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF3P17036 446 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTNR1AP48039 350 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 MELKQ14680 651 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL22Q53GT1 634 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 LGALS12Q96DT0 336 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDM14Q9GZV8 571 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED20Q9H944 212 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNGP01579 166 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNGR1P15260 489 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSMB9P28065 219 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLRB1Q12918 225 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NHLRC1Q6VVB1 395 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 GID4Q8IVV7 300 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 UEVLDQ8IX04 471 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDR9C7Q8NEX9 313 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52I1Q8NGK6 324 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SARAFQ96BY9 339 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 TXNDC15Q96J42 360 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED29Q9NX70 200 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 IMPA2O14732 288 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 TXNDC12O95881 172 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHMP01871 453 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 HTR1FP30939 366 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL27P61353 136 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB40BQ12829 278 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGADQ13349 1161 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PON3Q15166 354 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC35D2Q76EJ3 337 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHMP1BQ7LBR1 199 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 GHDCQ8N2G8 530 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 HCAR1Q9BXC0 346 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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