RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 C11orf88Q6PI97 169 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 NAXDQ8IW45 347 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 OR1E3Q8WZA6 343 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 CCDC74AQ96AQ1 378 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 FAM74A7A6NL05 159 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 XRCC3O43542 346 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 GTF2F2P13984 249 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 MPGP29372 298 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 FNTBP49356 437 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 FAM74A3Q4VXF1 159 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 NKAIN2Q5VXU1 208 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 SLC25A28Q96A46 364 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 SPACA7Q96KW9 195 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 GAL3ST1Q99999 423 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 WDR13Q9H1Z4 485 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 IFT46Q9NQC8 304 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 OR6C74A6NCV1 312 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 PCP4L1A6NKN8 68 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 RAD1O60671 282 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 CCL5P13501 91 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 PRKACAP17612 351 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 GJA4P35212 333 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ABHD13Q7L211 337 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 DNAJA3Q96EY1 480 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 SLITRK2Q9H156 845 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 MPDZO75970 2070 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 TRAV18A0A075B6X5 111 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GTQ1 180 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ABHD16AO95870 558 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 AK1P00568 194 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 GLULP15104 373 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 MNDAP41218 407 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 C4orf46Q504U0 113 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 SLC35D3Q5M8T2 416 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 CA13Q8N1Q1 262 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 GATSQ8NAP1 163 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 OR4C3Q8NH37 302 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ST8SIA2Q92186 375 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 TMEM106AQ96A25 262 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 OR2M4Q96R27 311 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 SLC38A3Q99624 504 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 IKZF2Q9UKS7 526 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 CTAG2O75638 210 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 F13BP05160 661 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 S1PR1P21453 382 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 NPSR1Q6W5P4 371 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 LRFN5Q96NI6 719 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ETV7Q9Y603 341 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 A0A087WUJ7 227 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 GGT3PA6NGU5 568 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ARPC3O15145 178 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 SEC13P55735 322 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 RCBTB1Q8NDN9 531 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 PATE1Q8WXA2 126 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 LYRM4Q9HD34 91 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 FOXS1O43638 330 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 OR6N1Q8NGY5 312 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 WDR76Q9H967 626 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 RNF44Q7L0R7 432 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 AMELYQ99218 206 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 EXO5Q9H790 373 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 OR4C45A6NMZ5 311 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 RDH16O75452 317 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 GNRH1P01148 92 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 DMWDQ09019 674 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 LY6G6FQ5SQ64 297 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 FAM220AQ7Z4H9 259 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 EXD3Q8N9H8 876 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ZNF524Q96C55 264 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 APMAPQ9HDC9 416 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 STEAP1Q9UHE8 339 aa22.97■■□□□ 1.27
SENP3-201ENST00000321337 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms