RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 NHLRC1Q6VVB1 395 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.25■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 A0A1W2PRG6 482 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 TMCC2O75069 709 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 BCL10O95999 233 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 SOD3P08294 240 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 IFI30P13284 250 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 PAX7P23759 505 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 C16orf89Q6UX73 402 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 WDFY1Q8IWB7 410 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 OR6X1Q8NH79 312 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 GSX2Q9BZM3 304 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 NDE1Q9NXR1 346 aa22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 MCIDASD6RGH6 385 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 FAM107AO95990 144 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 IGF2P01344 180 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 F13BP05160 661 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 DANCRP0C864 163 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 PGGHGQ32M88 737 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 IGFBPL1Q8WX77 278 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF566Q969W8 418 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 CDRT15Q96T59 188 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 NELFAQ9H3P2 528 aa22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 E7EQL1 145 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 AQP2P41181 271 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 MNAT1P51948 309 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ATP5J2P56134 94 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 INIPQ9NRY2 104 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 MOKQ9UQ07 419 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 V9GYQ6 96 aa22.22■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 FFAR1O14842 300 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 CDKN1AP38936 164 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 FABP6P51161 128 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 CLRN1P58418 232 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 AGAP6Q5VW22 663 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 RRM2BQ7LG56 351 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 NRMQ8IXM6 262 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 CDK20Q8IZL9 346 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 FBXL14Q8N1E6 418 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 DHRS9Q9BPW9 319 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 GLTPQ9NZD2 209 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 ENPP4Q9Y6X5 453 aa22.21■■□□□ 1.15
CTXN1-201ENST00000318978 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 CD79AP11912 226 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 HSD17B1P14061 328 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 FUT4P22083 530 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 KRT72Q14CN4 511 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 LAPTM4AQ15012 233 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 FITM2Q8N6M3 262 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 LIPHQ8WWY8 451 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM54Q969K7 222 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 FOXB1Q99853 325 aa22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 IGHG1P01857 330 aa22.19■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 CRYAAP02489 173 aa22.19■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 B4GALT1P15291 398 aa22.19■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 DAP3P51398 398 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 NPRL3Q12980 569 aa22.19■■□□□ 1.14
CTXN1-201ENST00000318978 PRSS57Q6UWY2 283 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms