RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SSX6Q7RTT6 188 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT16Q8N428 558 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5B2Q96R09 309 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 HES7Q9BYE0 225 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT4Q9H2B2 425 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CHST11Q9NPF2 352 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FANCFQ9NPI8 374 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ARGFXA6NJG6 315 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 M0R3G1 203 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF9O43307 516 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 AIREO43918 545 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RCVRNP35243 200 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TLE3Q04726 772 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 26.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PIEZO1Q92508 2521 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NL46 340 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 J3QRK9 145 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6A2O95222 327 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CPEP16870 476 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CNR1P21554 472 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ACVR1BP36896 505 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GALEQ14376 348 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MELKQ14680 651 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CARTPTQ16568 116 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RAET1LQ5VY80 246 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52N1Q8NH53 320 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FNDC8Q8TC99 324 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG12Q9BV10 488 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG8Q9BVK2 526 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DKKL1Q9UK85 242 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A1O15245 554 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SELENOFO60613 162 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RAMP1O60894 148 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GPX5O75715 221 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GLCEO94923 617 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKAR1AP10644 381 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SRD5A2P31213 254 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1C1Q15619 314 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf87Q6PH81 154 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF511Q8NB15 262 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MIB2Q96AX9 1013 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NUAK2Q9H093 628 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DAPL1A0PJW8 107 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS37A4D1T9 235 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OCM2P0CE71 109 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNGR1P15260 489 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF17P17021 662 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NAT1P18440 290 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CD97P48960 835 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SOX8P57073 446 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 POU4F2Q12837 409 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CLN3Q13286 438 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TPBGQ13641 420 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNDC15Q96J42 360 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PNV4 684 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYBB2P43320 205 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LGALS3BPQ08380 585 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSM1Q08AH1 577 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 VASNQ6EMK4 673 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms