RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GJC3Q8NFK1 279 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR5T1Q8NG75 326 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZPBPQ9BS86 351 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GCM1Q9NP62 436 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GUL6 1792 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 A0A087WZY1 265 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FRS3O43559 492 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LIM2P55344 173 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CHRNEQ04844 493 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MDGA2Q7Z553 956 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ABHD4Q8TB40 342 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A12Q96S37 553 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ABHD6Q9BV23 337 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 JAM3Q9BX67 310 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 P2RY12Q9H244 342 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OPA3Q9H6K4 179 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PQ09 198 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 A6NL46 340 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CHRM2P08172 466 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR8U8P0C7N1 319 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BTG1P62324 171 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FAM189BP81408 668 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MED25Q71SY5 747 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 COX15Q7KZN9 410 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR2T11Q8NH01 316 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TECTBQ96PL2 329 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GLAP06280 429 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GLB1P16278 677 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NFYBP25208 207 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SPCS2Q15005 226 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZTK2 550 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FCRLAQ7L513 359 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LAT2Q9GZY6 243 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RCE1Q9Y256 329 aa6.67□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LRP5O75197 1615 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RREB1Q92766 1687 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 H0YIG0 161 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 J3KTA2 159 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP33O14559 1287 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TAAR5O14804 337 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DTYMKP23919 212 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BCL6P41182 706 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KIR2DS4P43632 304 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RGRP47804 291 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BIDP55957 195 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BAXQ07812 192 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KIR2DS1Q14954 304 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LRRC18Q8N456 261 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FRZBQ92765 325 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF583Q96ND8 569 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DOBP13765 273 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TCN2P20062 427 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PGGT1BP53609 377 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CSNK1G2P78368 415 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RELAQ04206 551 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FGFBP1Q14512 234 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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