RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	SPI1	P17947	270 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ADCYAP1	P18509	176 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	MPPED2	Q15777	294 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GUCA2B	Q16661	112 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	RASD2	Q96D21	266 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	COA4	Q9NYJ1	87 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	MLX	Q9UH92	298 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501		H7C2Y5	167 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ATG12	O94817	140 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	GP1BA	P07359	652 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	MTSS1L	Q765P7	747 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM17	Q86X19	198 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	COX18	Q8N8Q8	333 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	POFUT1	Q9H488	388 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	EXO5	Q9H790	373 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ETV7	Q9Y603	341 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	XRCC3	O43542	346 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TNFRSF17	Q02223	184 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	GAS6	Q14393	721 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	STAR	P49675	285 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	EMD	P50402	254 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	HERVK_113	Q902F9	699 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	IGLON5	A6NGN9	336 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	RASGRP1	O95267	797 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	FHL5	Q5TD97	284 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	LILRA6	Q6PI73	481 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF511	Q8NB15	262 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ASB12	Q8WXK4	309 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	BAD	Q92934	168 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	IL23A	Q9NPF7	189 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	GGT3P	A6NGU5	568 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	DISC1	C4P0D8	188 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	P2RY2	P41231	377 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	DHCR24	Q15392	516 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501		Q499Y3	187 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	KRT77	Q7Z794	578 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TSSK2	Q96PF2	358 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	CAPN10	Q9HC96	672 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	LDB3	O75112	727 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	SLC25A12	O75746	678 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	NDUFB2	O95178	105 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	CSF1	P09603	554 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ODF4	Q2M2E3	257 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	MNT	Q99583	582 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	FAM117A	Q9C073	453 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	CTAG2	O75638	210 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	TMIE	Q8NEW7	156 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	PTPRS	Q13332	1948 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PMS1-222	ENST00000639501	UPK3A	O75631	287 aa		18.67	■□□□□ 0.58

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