RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 SERTAD2Q14140 314 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 KCNJ11Q14654 390 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TRAM2Q15035 370 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TNXAQ16473 311 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ATP6V1FQ16864 119 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RGS21Q2M5E4 152 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RPEL1Q2QD12 228 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CCDC14Q49A88 953 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MS4A13Q5J8X5 152 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 WDR38Q5JTN6 314 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CDKL4Q5MAI5 379 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ACER2Q5QJU3 275 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MUC21Q5SSG8 566 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 UTF1Q5T230 341 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SEL1L2Q5TEA6 688 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 FAM219BQ5XKK7 198 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZNF626Q68DY1 528 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ADNP2Q6IQ32 1131 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RFWD3Q6PCD5 774 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 C9orf139Q6ZV77 190 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SH2D5Q6ZV89 423 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 C16orf82Q7Z2V1 217 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MRGPRGQ86SM5 289 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZNF547Q8IVP9 402 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SVOPLQ8N434 492 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 STPG4Q8N801 248 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CLEC18CQ8NCF0 446 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR2AP1Q8NGE2 309 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR52B6Q8NGF0 335 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR6K6Q8NGW6 343 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR5K2Q8NHB8 316 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ITFG1Q8TB96 612 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MRAPQ8TCY5 172 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CXorf40AQ8TE69 158 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CCDC127Q96BQ5 260 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 FAM122AQ96E09 287 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MOCOSQ96EN8 888 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TMEM80Q96HE8 168 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 C9orf85Q96MD7 179 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SERPINB11Q96P15 392 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 IL17FQ96PD4 163 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MS4A4EQ96PG1 132 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SORT1Q99523 831 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HSD17B14Q9BPX1 270 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 FAIM2Q9BWQ8 316 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ADNPQ9H2P0 1102 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RETNQ9HD89 108 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 DEPPQ9NTK1 212 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 NECAP2Q9NVZ3 263 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MCUBQ9NWR8 336 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HMGXB4Q9UGU5 601 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 DCDC2Q9UHG0 476 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CLEC2DQ9UHP7 191 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 LGALS13Q9UHV8 139 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RARRES3Q9UL19 164 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 FBXO7Q9Y3I1 522 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.09□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CDHR2Q9BYE9 1310 aa2.09□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CKAP5Q14008 2032 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 A0A1B0GTH9 108 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TRABD2BA6NFA1 517 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 VSTM2BA6NLU5 285 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TMEM210A6NLX4 147 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 C15orf61A6NNL5 157 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 USP27XA6NNY8 438 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 E9PLD3 99 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 H3BN98 237 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 MKRN2OSH3BPM6 223 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 SMLR1H3BR10 107 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GFYI3L273 518 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 K7EQD1 137 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CDC7O00311 574 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 PLPP1O14494 284 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 EMC8O43402 210 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 BUB3O43684 328 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 PCDH7O60245 1069 aa2.08□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 MAGEC1O60732 1142 aa2.08□□□□□ -2.08
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