RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 SSX4O60224 188 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CH25HO95992 272 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 MT-ATP6P00846 226 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 PAX7P23759 505 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CAPZA2P47755 286 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ERICH5Q6P6B1 374 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CALHM3Q86XJ0 350 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM123Q8N131 208 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKK1Q8NFD2 765 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5J2Q8NH18 312 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 TXNDC15Q96J42 360 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC134Q9H6E4 229 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ARMCX1Q9P291 453 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 BAG5Q9UL15 447 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC35F4A4IF30 521 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf98E9PRG8 122 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 PLPP3O14495 311 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNA14P01570 189 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CRYAAP02489 173 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ADORA3P0DMS8 318 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 BMP4P12644 408 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CHRNB3Q05901 458 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 LINC00114Q6XXX2 140 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR88Q6ZMY6 472 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CARM1Q86X55 608 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 OR6N1Q8NGY5 312 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 C10orf82Q8WW14 230 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 MPP4Q96JB8 637 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 USP22Q9UPT9 525 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 SEC14L2O76054 403 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST1H2ABP04908 130 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 MDH1P40925 334 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 NUDT6P53370 316 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB35Q15286 201 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 C20orf196Q8IYI0 205 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 HTRA1Q92743 480 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST1H2ACQ93077 130 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 THY1P04216 161 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 UMPSP11172 480 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFRSF1BP20333 461 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CRYBA2P53672 197 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CAMK2DQ13557 499 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf71Q6IPW1 123 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 DEF8Q6ZN54 512 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 PXKQ7Z7A4 578 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 POU5F2Q8N7G0 328 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 RCN3Q96D15 328 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF583Q96ND8 569 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 NELFAQ9H3P2 528 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 NANSQ9NR45 359 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-215ENST00000621029 LYPD3O95274 346 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R41P59536 307 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF74Q16587 644 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PHYHD1Q5SRE7 291 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 FBXO17Q96EF6 278 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 KATNB1Q9BVA0 655 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 REG4Q9BYZ8 158 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 ULBP2Q9BZM5 246 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PCDHAC1Q9H158 963 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 POFUT2Q9Y2G5 429 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC22A2O15244 555 aa25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CECR9P0C854 216 aa25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 NPRL3Q12980 569 aa25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 VHLLQ6RSH7 139 aa25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T12Q8NG77 320 aa25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 RHNO1Q9BSD3 238 aa25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PLCE1Q9P212 2302 aa25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM220BPB1ANY3 271 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF13O43567 381 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNGR1P15260 489 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CBR1P16152 277 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PCSK6P29122 969 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 BIDP55957 195 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 NAAAQ02083 359 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC17Q8N6Y2 441 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 TPD52L3Q96J77 140 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 LRR1Q96L50 414 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC19A3Q9BZV2 496 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC22O60826 627 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 OR1E2P47887 323 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CSNK1A1P48729 337 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CYBRD1Q53TN4 286 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF813Q6ZN06 617 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC35D2Q76EJ3 337 aa25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms