RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 PTAFRP25105 342 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 IFNA8P32881 189 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 UGT2B15P54855 530 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 TMEM108Q6UXF1 575 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 IGFBPL1Q8WX77 278 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 FAM162AQ96A26 154 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HSH2DQ96JZ2 352 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 LRR1Q96L50 414 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R5Q9NYW4 299 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 OR6A2O95222 327 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HSD17B1P14061 328 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 NCK1P16333 377 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 PRPS1P60891 318 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 SLC25A3Q00325 362 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 FXNQ16595 210 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 GPR137CQ8N3F9 429 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 PFN4Q8NHR9 129 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 LIPHQ8WWY8 451 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 TXNDC15Q96J42 360 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 GPR35Q9HC97 309 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 MED29Q9NX70 200 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.8■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 SLC35F4A4IF30 521 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HTR3EA5X5Y0 456 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 WNT11O96014 354 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HIST1H2ABP04908 130 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HIKESHIQ53FT3 197 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 KLHL24Q6TFL4 600 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 FKBP9P1Q75LS8 142 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 C20orf196Q8IYI0 205 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 RADILQ96JH8 1075 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 EMC6Q9BV81 110 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 NDE1Q9NXR1 346 aa21.79■■□□□ 1.08
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PMS1-220ENST00000618056 MED31Q9Y3C7 131 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 MTORP42345 2549 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 C11orf98E9PRG8 122 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ABCD4O14678 606 aa21.78■■□□□ 1.08
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PMS1-220ENST00000618056 ZNF83P51522 516 aa21.78■■□□□ 1.08
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PMS1-220ENST00000618056 GLYATQ6IB77 296 aa21.78■■□□□ 1.08
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PMS1-220ENST00000618056 NELFAQ9H3P2 528 aa21.78■■□□□ 1.08
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PMS1-220ENST00000618056 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.78■■□□□ 1.08
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PMS1-220ENST00000618056 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 FNDC11Q9BVV2 318 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 GORASP2Q9H8Y8 452 aa21.77■■□□□ 1.08
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PMS1-220ENST00000618056 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 CD300AQ9UGN4 299 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-220ENST00000618056 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa21.77■■□□□ 1.07
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PMS1-220ENST00000618056 SERPINI2O75830 405 aa21.77■■□□□ 1.07
PMS1-220ENST00000618056 IFNGR1P15260 489 aa21.77■■□□□ 1.07
PMS1-220ENST00000618056 FUT1P19526 365 aa21.77■■□□□ 1.07
PMS1-220ENST00000618056 YAP1P46937 504 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
PMS1-220ENST00000618056 CEACAM16Q2WEN9 425 aa21.77■■□□□ 1.07
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PMS1-220ENST00000618056 C16orf89Q6UX73 402 aa21.77■■□□□ 1.07
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PMS1-220ENST00000618056 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.77■■□□□ 1.07
PMS1-220ENST00000618056 WDFY1Q8IWB7 410 aa21.77■■□□□ 1.07
PMS1-220ENST00000618056 OR6X1Q8NH79 312 aa21.77■■□□□ 1.07
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