RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617875.4

RECQL4-209, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RECQL4, Length 3,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-209ENST00000617875 FAM60AQ9NP50 221 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NCDNQ9UBB6 729 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LILRB3O75022 631 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 KIR2DS3Q14952 304 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GPR119Q8TDV5 335 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 EMC6Q9BV81 110 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TSC2P49815 1807 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 AHSA1O95433 338 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FCRL1Q96LA6 429 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 DHDHQ9UQ10 334 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 C17orf51A8MQB3 221 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TEKQ02763 1124 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 STK11Q15831 433 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 Q6ZTK2 550 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CMC2Q9NRP2 79 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NBASA2RRP1 2371 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 F5H5P2 479 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CYB5AP00167 134 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 RLN2P04090 185 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 S100A10P60903 97 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LTBQ06643 244 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 VWA2Q5GFL6 755 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FAM219AQ8IW50 185 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SCGB1D2O95969 90 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 RECKO95980 971 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF28P17035 718 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TPMTP51580 245 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 EMC7Q9NPA0 242 aa14.66□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CTNSO60931 367 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ATP1B1P05026 303 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SLC2A5P22732 501 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NRG3P56975 720 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ALG11Q2TAA5 492 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CD276Q5ZPR3 534 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF546Q86UE3 836 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PDE7BQ9NP56 450 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 MAFFQ9ULX9 164 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 A0A0J9YY10 115 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SLC6A1P30531 599 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GFERP55789 205 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CBLN3Q6UW01 205 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TSLPQ969D9 159 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PELI1Q96FA3 418 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GDE1Q9NZC3 331 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 HCKP08631 526 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ACSM4P0C7M7 580 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GLI4P10075 376 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 COL9A1P20849 921 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LSSP48449 732 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR10A5Q9H207 317 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 G3V3Y1 287 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 S1PR1P21453 382 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CDK2P24941 298 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms