RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN4-210ENST00000588618 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN4-210ENST00000588618 AASSQ9UDR5 926 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN4-210ENST00000588618 IDH3BO43837 385 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN4-210ENST00000588618 BCL10O95999 233 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTN4-210ENST00000588618 APEHP13798 732 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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ACTN4-210ENST00000588618 IL18R1Q13478 541 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTN4-210ENST00000588618 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN4-210ENST00000588618 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTN4-210ENST00000588618 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTN4-210ENST00000588618 SURF4O15260 269 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 PRKYO43930 277 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 MPZL2O60487 215 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 PCYT1AP49585 367 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 BIDP55957 195 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 RAP1BP61224 184 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 RAP1AP62834 184 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTN4-210ENST00000588618 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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