RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		J3QRE1	110 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SGK494	L7N484	410 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IMPA2	O14732	288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PDCD5	O14737	125 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ARPC3	O15145	178 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRTM2	O43300	516 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF749	O43361	778 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PLPP2	O43688	288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPRIN2	O60269	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTSV	O60911	334 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNK	O75909	580 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF432	O94892	652 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFB2	O95178	105 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EGF	P01133	1207 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UBL4A	P11441	157 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IL7	P13232	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GNS	P15586	552 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CEL	P19835	753 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACSL1	P33121	698 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DDOST	P39656	456 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NR4A2	P43354	598 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FASLG	P48023	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A8	P48029	635 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RFX3	P48380	749 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF136	P52737	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP12A	P54707	1039 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GAS1	P54826	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UCP3	P55916	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CLDN2	P57739	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	QPRT	Q15274	297 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PARG	Q86W56	976 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM3C	Q92520	227 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HTRA1	Q92743	480 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UCN3	Q969E3	161 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ART5	Q96L15	291 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPA33	Q99795	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTRC	Q99895	268 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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