RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 PLPP3O14495 311 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ARPC2O15144 300 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 PIP5K1CO60331 668 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 OR7A10O76100 309 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 LYPD3O95274 346 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 WNT11O96014 354 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 HRGP04196 525 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 THBDP07204 575 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 IFI30P13284 250 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ITGA2P17301 1181 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 FUT1P19526 365 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 DNASE1P24855 282 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 MPGP29372 298 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 NTF4P34130 210 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 UGT2B15P54855 530 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 NR1H2P55055 460 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 KEAP1Q14145 624 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 TRAM2Q15035 370 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 TAB1Q15750 504 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 SPATS1Q496A3 300 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 FGD3Q5JSP0 725 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 PFN4Q8NHR9 129 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 NRGNQ92686 78 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 PYURFQ96I23 114 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 C18orf12Q96KH6 178 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 LRGUKQ96M69 825 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 EMC6Q9BV81 110 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 MED29Q9NX70 200 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 MALT1Q9UDY8 824 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 RCE1Q9Y256 329 aa6.85□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ABCA4P78363 2273 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PRG6 482 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 SLC35F4A4IF30 521 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 OR5H1A6NKK0 313 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 M0R3G1 203 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 CLOCKO15516 846 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 UBOX5O94941 541 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 DIRAS1O95057 198 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 BCL10O95999 233 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 HPRP00739 348 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 FABP3P05413 133 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 CD3EP07766 207 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ITGA5P08648 1049 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 HLA-DOBP13765 273 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 IFNGR1P15260 489 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 COX5AP20674 150 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 CAPZA2P47755 286 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ZNF83P51522 516 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 BIDP55957 195 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 LGALS3BPQ08380 585 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 CAMK2DQ13557 499 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 MELKQ14680 651 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 TAF11Q15544 211 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 GABRA6Q16445 453 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 SSX8Q7RTT4 187 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 PXKQ7Z7A4 578 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 TXNDC15Q96J42 360 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 OR2M2Q96R28 347 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 SEPHS2Q99611 448 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 LIME1Q9H400 295 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.84□□□□□ -1.31
SMG6-211ENST00000572369 CD300AQ9UGN4 299 aa6.84□□□□□ -1.31
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