RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf82	Q8WW14	230 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CRLF2	Q9HC73	371 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CR1	P17927	2039 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A2	O15244	555 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV1-44	P01699	117 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	FABP6	P51161	128 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBA1B	P68363	451 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBA4A	P68366	448 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PMS2P3	Q13401	168 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBA1A	Q71U36	451 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PXK	Q7Z7A4	578 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNDC15	Q96J42	360 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MPP4	Q96JB8	637 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	LRR1	Q96L50	414 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MED4	Q9NPJ6	270 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MED29	Q9NX70	200 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MOK	Q9UQ07	419 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		18.97	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV3-15	P01624	115 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	IL1RL1	Q01638	556 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF74	Q16587	644 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5J2	Q8NH18	312 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	EMC6	Q9BV81	110 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMCX1	Q9P291	453 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		18.96	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35F4	A4IF30	521 aa		18.95	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		18.95	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		18.95	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		18.95	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		18.95	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200		H7C417	338 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R3G1	203 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CECR9	P0C854	216 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF627	Q7L945	461 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CARM1	Q86X55	608 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	PROX1	Q92786	737 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	GID8	Q9NWU2	228 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	BAG5	Q9UL15	447 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF223	E7ERA6	249 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CH25H	O95992	272 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ADORA3	P0DMS8	318 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF1B	P20333	461 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	AHCY	P23526	432 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	NAAA	Q02083	359 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ZP4	Q12836	540 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MST1L	Q2TV78	715 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CARD17	Q5XLA6	110 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	RCN3	Q96D15	328 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	REG4	Q9BYZ8	158 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYAA	P02489	173 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CBR1	P16152	277 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CALCR	P30988	508 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK2D	Q13557	499 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	NANS	Q9NR45	359 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX4	O60224	188 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC14L2	O76054	403 aa		18.91	■□□□□ 0.62

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