RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TUBA1A	Q71U36	451 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PFN4	Q8NHR9	129 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ALG2	Q9H553	416 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	FKRP	Q9H9S5	495 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SLC35F4	A4IF30	521 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996		E7EQL1	145 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	C11orf98	E9PRG8	122 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CXCR6	O00574	342 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SERPINI2	O75830	405 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CD8A	P01732	235 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ADORA3	P0DMS8	318 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PRDX6	P30041	224 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PSME3	P61289	254 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PXK	Q7Z7A4	578 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CRLF2	Q9HC73	371 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996		M0R3G1	203 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	AHCY	P23526	432 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SLC22A25	Q6T423	547 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	NANS	Q9NR45	359 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	FFAR1	O14842	300 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF9	O43307	516 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SEC14L2	O76054	403 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	MT-ND1	P03886	318 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	IFNGR1	P15260	489 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	NCK1	P16333	377 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ZP4	Q12836	540 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CAMK2D	Q13557	499 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	DTX2	Q86UW9	622 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TMEM239	Q8WW34	195 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	RADIL	Q96JH8	1075 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996		J3KTA2	159 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	PIP5K1C	O60331	668 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	TMCC2	O75069	709 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	WNT11	O96014	354 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	CDKN1A	P38936	164 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	CBLL1	Q75N03	491 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	LRR1	Q96L50	414 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	PRRC1	Q96M27	445 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996		Q96MF0	132 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	TRIM64B	A6NI03	449 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	GSTA4	O15217	222 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	OR7A10	O76100	309 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-222	ENST00000550996	ZNF682	O95780	498 aa		18.19	■□□□□ 0.5

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