RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 NUMA1Q14980 2115 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 A0A1B0GTI1 187 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 IMPA2O14732 288 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 BCL2L11O43521 198 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 UPK3AO75631 287 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 KDM4BO94953 1096 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SPDEFO95238 335 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RASGRP1O95267 797 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GNRH1P01148 92 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CNR1P21554 472 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MST1P26927 711 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PRPS1P60891 318 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MC2RQ01718 297 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RUNX2Q13950 521 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 STPG1Q5TH74 334 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 C11orf88Q6PI97 169 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GPR148Q8TDV2 347 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SUSD6Q92537 303 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PBX4Q9BYU1 374 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DEC1Q9P2X7 70 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 KCNK6Q9Y257 313 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR6C68A6NDL8 312 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TMEM212A6NML5 194 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 EFCAB7A8K855 629 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NUDT19A8MXV4 375 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CTAG2O75638 210 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ABHD16AO95870 558 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GP1BAP07359 652 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GTF2F2P13984 249 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GABRA3P34903 492 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PRSS3P35030 304 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RPL4P36578 427 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 STARP49675 285 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TAS2R19P59542 299 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DEFB103AP81534 67 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ZNF141Q15928 474 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ABHD13Q7L211 337 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ZNF546Q86UE3 836 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 EXD3Q8N9H8 876 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 VWCEQ96DN2 955 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ALG12Q9BV10 488 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 EXO5Q9H790 373 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 IL21RQ9HBE5 538 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 A0A087WUJ7 227 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 H7C2Y5 167 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PHYHO14832 338 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TNFSF14O43557 240 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GPR75O95800 540 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 WNT11O96014 354 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PTHLHP12272 177 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GLULP15104 373 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DRD3P35462 400 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CBX5P45973 191 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 EMDP50402 254 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MGAT2Q10469 447 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GAB4Q2WGN9 574 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 C4orf46Q504U0 113 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PGAP1Q75T13 922 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms