RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CAPZBP47756 277 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PXKQ7Z7A4 578 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 OR14A2Q96R54 314 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PHB2Q99623 299 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 DDAH2O95865 285 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 C1QAP02745 245 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 AKAIN1P0CW23 69 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SERPINA2P20848 420 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PCBD1P61457 104 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ZNF616Q08AN1 781 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 TATDN3Q17R31 274 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CMIPQ8IY22 773 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 TMEM212A6NML5 194 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SLC43A1O75387 559 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CSO75390 466 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SNAPC5O75971 98 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SEC14L2O76054 403 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SLC35A1P78382 337 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 MFAP5Q13361 173 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 RUNX2Q13950 521 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 GRINAQ7Z429 371 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 C8orf44Q96CB5 159 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 EMC6Q9BV81 110 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 WDR76Q9H967 626 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 NOX4Q9NPH5 578 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 KCNK2O95069 426 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 IFNA5P01569 189 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 APOC3P02656 99 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SBK2P0C263 348 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 EPHA2P29317 976 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 RGS19P49795 217 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 TSC22D1Q15714 1073 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 Q499Y3 187 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 AGAP6Q5VW22 663 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 AGAP4Q96P64 663 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 TEAD3Q99594 435 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 GOSR2O14653 212 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 IFNGR1P15260 489 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ADH6P28332 368 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CAV2P51636 162 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 HBMQ6B0K9 141 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 NEU3Q9UQ49 428 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 A0A1B0GV50 99 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 LMO7DNF2Z398 122 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 M0R082 166 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 PRAF2O60831 178 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SERPINE2P07093 398 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-201ENST00000537686 SMIM18P0DKX4 95 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms