RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 M0R233 179 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 LILRA1O75019 489 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF432O94892 652 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 RAB36O95755 333 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 HLA-HP01893 362 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 TACSTD2P09758 323 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ITGA2P17301 1181 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 AHCYP23526 432 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GIFP27352 417 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 RGNQ15493 299 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 C12orf54Q6X4T0 127 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SNX32Q86XE0 403 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 NFKBIDQ8NI38 313 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 OR2M2Q96R28 347 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 EPYCQ99645 322 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SYT3Q9BQG1 590 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 PARD6BQ9BYG5 372 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM27Q9HBJ8 222 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 CHST2Q9Y4C5 530 aa13.13□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 A0A1B0GWA3 101 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM129A0AVI4 362 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 FADDQ13158 208 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 PMS2P3Q13401 168 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 CAMK2DQ13557 499 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MFSD13AQ14CX5 517 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ULK3Q6PHR2 472 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GLCCI1Q86VQ1 547 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 C1orf159Q96HA4 380 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 C12orf10Q9HB07 376 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 LPAR2Q9HBW0 351 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 DYSFO75923 2080 aa13.12□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 A0A1W2PPW3 197 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SYNGR3O43761 229 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 OR6A2O95222 327 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 B4GALT1P15291 398 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 NR4A1P22736 598 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 PRKAR1BP31321 381 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ALDH3B1P43353 468 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 AQP5P55064 265 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 CDH15P55291 814 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 PHYHD1Q5SRE7 291 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 REP15Q6BDI9 236 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SLC35B4Q969S0 331 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 OR52B2Q96RD2 323 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MED29Q9NX70 200 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 DUSP13Q9UII6 198 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 FZR1Q9UM11 496 aa13.11□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 A0A087WUJ7 227 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 B4DSR2 109 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 C11orf98E9PRG8 122 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MS4A18H0YCH9 400 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 SNNO75324 88 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 HLA-DOBP13765 273 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ETS2P15036 469 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 RAB1AP62820 205 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 RIN1Q13671 783 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 REEP3Q6NUK4 255 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM123Q8N131 208 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GTF2H4Q92759 462 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 TXNDC15Q96J42 360 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF607Q96SK3 696 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 KLHL14Q9P2G3 628 aa13.1□□□□□ -0.31
BRPF3-210ENST00000532538 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms