RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF682O95780 498 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ADORA3P0DMS8 318 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CDKN1AP38936 164 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 HMBOX1Q6NT76 420 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 C17orf78Q8N4C9 275 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SMR3AQ99954 134 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CRLF2Q9HC73 371 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.39■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 NDUFS7O75251 213 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 OR5F1O95221 314 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MT-ATP6P00846 226 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SERPINA1P01009 418 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CD8AP01732 235 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CELA3BP08861 270 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 UMPSP11172 480 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 IFNGR1P15260 489 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SELENOWP63302 87 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TGFBR3Q03167 851 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SLC22A25Q6T423 547 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 GPR137CQ8N3F9 429 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM171Q8WVE6 324 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 HTRA1Q92743 480 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MPP4Q96JB8 637 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 HSH2DQ96JZ2 352 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 FKRPQ9H9S5 495 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 NOX3Q9HBY0 568 aa16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM64A6NGJ6 449 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM64BA6NI03 449 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 FFAR1O14842 300 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 GSTA4O15217 222 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 IFNA14P01570 189 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 PRDX6P30041 224 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 BIDP55957 195 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 PRPS1P60891 318 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM108Q6UXF1 575 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 FAM86B1Q8N7N1 296 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 PRRC1Q96M27 445 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 Q96MF0 132 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 NANSQ9NR45 359 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.37■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MT-ND1P03886 318 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 PTAFRP25105 342 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 CBLL1Q75N03 491 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 PXKQ7Z7A4 578 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM239Q8WW34 195 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 GSX2Q9BZM3 304 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 MOKQ9UQ07 419 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.36■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 OVOL3O00110 214 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 RNF13O43567 381 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 OR7A10O76100 309 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 F13BP05160 661 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 RUNX1T1Q06455 604 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 FAM162AQ96A26 154 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SGTBQ96EQ0 304 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 RADILQ96JH8 1075 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.35■□□□□ 0.21
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms