RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	NSD2	O96028	1365 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A0G2JN53	185 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM150B	A6NC51	233 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619		E9PBE3	544 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	AGPAT2	O15120	278 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPPA	P01160	153 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	S100A6	P06703	90 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAPN1	P07384	714 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	HPGD	P15428	266 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	NMU	P48645	174 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNFRSF17	Q02223	184 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ASPH	Q12797	758 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLRB1	Q12918	225 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLA	Q13239	276 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	STK11	Q15831	433 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	PARP15	Q460N3	678 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRRC45	Q96CN5	670 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TPK1	Q9H3S4	243 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	REEP4	Q9H6H4	257 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	NTN4	Q9HB63	628 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB18	Q9NP72	206 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	MED4	Q9NPJ6	270 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	LHX9	Q9NQ69	397 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	GLRX2	Q9NS18	164 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	COX16	Q9P0S2	106 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCN2A	Q99250	2005 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619		L7N2F9	121 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCGN	O76038	276 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ASGR1	P07306	291 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	HSMCR30	P0CW71	290 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CXCR2	P25025	360 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	S100A5	P33763	92 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACTR1A	P61163	376 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZSCAN26	Q16670	478 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CARD16	Q5EG05	197 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA24	Q86W54	205 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDH26	Q8IXH8	852 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF596	Q8TC21	504 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	OXGR1	Q96P68	337 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	NAT9	Q9BTE0	207 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	IL20	Q9NYY1	176 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	DEC1	Q9P2X7	70 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619		H0YCG3	227 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPOP	O43791	374 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	UGT1A9	O60656	530 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	MOS	P00540	346 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF24	P17028	368 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	CMA1	P23946	247 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	FMO3	P31513	532 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	PKNOX1	P55347	436 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	MADCAM1	Q13477	382 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATP6AP1	Q15904	470 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	BCL7A	Q4VC05	210 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		3	□□□□□ -1.93
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		3	□□□□□ -1.93

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