RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	ACTR1A	P61163	376 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	IL13RA1	P78552	427 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	GUCA2B	Q16661	112 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	MANEA	Q5SRI9	462 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF626	Q68DY1	528 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	HERVK_113	Q902F9	699 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ALG12	Q9BV10	488 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM2	Q9C040	744 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	PLXNB2	O15031	1838 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	VEGFD	O43915	354 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFB6	O95139	128 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	GPANK1	O95872	356 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SCGB1D2	O95969	90 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	APOC1	P02654	83 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	CD2	P06729	351 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	CSF1	P09603	554 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	AVPR2	P30518	371 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	HSD17B2	P37059	387 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	CCR2	P41597	374 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SEC13	P55735	322 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB5B	P61020	215 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	BDH1	Q02338	343 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	DHCR24	Q15392	516 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB11B	Q15907	218 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR2W5	A6NFC9	320 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	WDPCP	O95876	746 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	AGR2	O95994	175 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ITGB8	P26012	769 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFS1	P28331	727 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	TMIE	Q8NEW7	156 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGDIG	Q99819	225 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	LHX9	Q9NQ69	397 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	MOK	Q9UQ07	419 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0G2JK05	382 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PP55	124 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	RHO	P08100	348 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	BDKRB2	P30411	391 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	BAMBI	Q13145	260 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ASPG	Q86U10	573 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	OR1S1	Q8NH92	325 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	ARL11	Q969Q4	196 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	C4orf47	A7E2U8	309 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	THY1	P04216	161 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ERCC3-208	ENST00000491292	HOXD10	P28358	340 aa		9.01	□□□□□ -0.97

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