RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPR27	Q9NS67	375 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GLS2	Q9UI32	602 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RP1	P56715	2156 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1B0GWA3	101 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BHLHE40	O14503	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CD38	P28907	300 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SST	P61278	116 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TIMP4	Q99727	224 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FKBP7	Q9Y680	259 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MPDZ	O75970	2070 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STK25	O00506	426 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HTR1F	P30939	366 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHAF1B	Q13112	559 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TPBG	Q13641	420 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR4C3	Q8NH37	302 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCTD7	Q96MP8	289 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A075B6Q4	140 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CD3G	P09693	182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC35E2	P0CK97	266 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AKR1C3	P42330	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXL2	P58012	376 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXK2	Q01167	660 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MEIOB	Q8N635	442 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RFK	Q969G6	155 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STAC	Q99469	402 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MNT	Q99583	582 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FN3K	Q9H479	309 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C4orf47	A7E2U8	309 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NKX2-2	O95096	273 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WDPCP	O95876	746 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BMP7	P18075	431 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AMZ1	Q400G9	498 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TCTE1	Q5JU00	501 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BMP8B	P34820	402 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ETV6	P41212	452 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CRMP1	Q14194	572 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		10.77	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms