RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CWH43Q9H720 699 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CA10Q9NS85 328 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PIGVQ9NUD9 493 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 RASD1Q9Y272 281 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ETV7Q9Y603 341 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GTI1 187 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CDHR4A6H8M9 788 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 URADA6NGE7 173 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PRRG1O14668 218 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TAAR5O14804 337 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SYT7O43581 403 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 HCRTR2O43614 444 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PCDH7O60245 1069 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 MED6O75586 246 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A12O75746 678 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 FGF19O95750 216 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 C6orf47O95873 294 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 GCGP01275 180 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 LRG1P02750 347 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 MT-ND4P03905 459 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CSF1P09603 554 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 FAM87AP0C7U9 286 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CALCBP10092 127 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 AMD1P17707 334 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SDC1P18827 310 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CELP19835 753 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PPP2R1BP30154 601 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 HTR1FP30939 366 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 AGTR2P50052 363 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PNLIPRP1P54315 467 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 DGCR2P98153 550 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 DOC2AQ14183 400 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 XKR4Q5GH76 650 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 OR52W1Q6IF63 320 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ZNF613Q6PF04 617 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A25Q6T423 547 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ACOT1Q86TX2 421 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 VRK2Q86Y07 508 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 BAP18Q8IXM2 172 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 ZFP82Q8N141 532 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CD200R1Q8TD46 325 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.56□□□□□ -1.36
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PKP4-211ENST00000481115 C14orf79Q96F83 325 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 STACQ99469 402 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 CHIAQ9BZP6 476 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TREM1Q9NP99 234 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TDP1Q9NUW8 608 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 V9GYS6 101 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 A0A087WWC5 75 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GW64 132 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-211ENST00000481115 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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