RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480058.5

PRPF4B-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF4B, Length 6,775 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-205ENST00000480058 APCDD1Q8J025 514 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 CORO2AQ92828 525 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PRPF4B-205ENST00000480058 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 MMP21Q8N119 569 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 DIO2Q92813 273 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 APOOQ9BUR5 198 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.69□□□□□ -1.5
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