RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 PON3Q15166 354 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TOMM20Q15388 145 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SYT14P1Q58G82 188 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RAET1LQ5VY80 246 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM225Q6GV28 225 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.31□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.31□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 ADCK1Q86TW2 530 aa6.31□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MDS2Q8NDY4 140 aa6.31□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 INIPQ9NRY2 104 aa6.31□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.31□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR2M5A3KFT3 312 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 LIPT2A6NK58 231 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CDC42EP2O14613 210 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SURF4O15260 269 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 RENP00797 406 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 STSP08842 583 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 ADORA3P0DMS8 318 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 SDHAP31040 664 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PTGER4P35408 488 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ATP6V1E1P36543 226 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 OR2B6P58173 313 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 BICRALQ6AI39 1079 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 AMER2Q8N7J2 671 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR2T4Q8NH00 348 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PFN4Q8NHR9 129 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FCGR1BQ92637 280 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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