RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473883.5

HCLS1-205, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 2,710 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-205	ENST00000473883	RAB31	Q13636	194 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TCEA2	Q15560	299 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RLN3	Q8WXF3	142 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM183A	A6NL82	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	KNG1	P01042	644 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	MMP2	P08253	660 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	GLB1	P16278	677 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FABP5	Q01469	135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	PAX5	Q02548	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	UBE2V2	Q15819	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM129C	Q86XR2	697 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	EPYC	Q99645	322 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RLN1	P04808	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	HOXB7	P09629	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	UCP1	P25874	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	AKT2	P31751	481 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	MMP16	P51512	607 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	CLDN12	P56749	244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	DAOA	P59103	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TMEM100	Q9NV29	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883		A0A1W2PPV4	95 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	HMBS	P08397	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	DRD5	P21918	477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	UGCG	Q16739	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SCLY	Q96I15	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SEMA3C	Q99985	751 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	C5	P01031	1676 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	SCGN	O76038	276 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	TNFSF15	O95150	251 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	NDUFB8	O95169	186 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HCLS1-205	ENST00000473883	HBA1	P69905	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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