RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469297.1

CACNA2D1-208, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, human

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TXN2	Q99757	166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WDR76	Q9H967	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		A0A0J9YVX5	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FBP2	O00757	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ANGPT2	O15123	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR4F21	O95013	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	THRB	P10828	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	EDNRA	P25101	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CA7	P43166	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HNMT	P50135	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CRYBA2	P53672	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PEX6	Q13608	980 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CYTH1	Q15438	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ABCA4	P78363	2273 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297		A0A1W2PQ67	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DPP4	P27487	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MIP	P30301	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HTR5A	P47898	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC1A6	P48664	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ARFIP1	P53367	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NAAA	Q02083	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RAD51	Q06609	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HAGH	Q16775	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.2 ms