RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 OR51J1Q9H342 316 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 NUP50Q9UKX7 468 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 AKAP6Q13023 2319 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 IL33O95760 270 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 AIFM1O95831 613 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 IL1AP01583 271 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 GCGRP47871 477 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SOX2P48431 317 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 GIPRP48546 466 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 DNASE1L1P49184 302 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 FOXK1P85037 733 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 PMP22Q01453 160 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 PUDPQ08623 228 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SYPL1Q16563 259 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 C18orf63Q68DL7 685 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 CPOQ8IVL8 374 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SPERTQ8NA61 448 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 TTC9Q92623 222 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 OPALINQ96PE5 141 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 MCHR1Q99705 422 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 OR10A5Q9H207 317 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 MYOTQ9UBF9 498 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 RASD1Q9Y272 281 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJC13O75165 2243 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 H0YIV9 168 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ARPC5O15511 151 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 HCRTR2O43614 444 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 PRKYO43930 277 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 COX6A1P12074 109 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 PEPDP12955 493 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 KHKP50053 298 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 TNFSF10P50591 281 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 PITPNAQ00169 270 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 GALK2Q01415 458 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 P2RY14Q15391 338 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC190Q86UF4 302 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CD163Q86VB7 1156 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 MMP21Q8N119 569 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 OR8S1Q8NH09 359 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 APH1BQ8WW43 257 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 MED11Q9P086 117 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 USP24Q9UPU5 2620 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD36A6QL64 1941 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 SCN3AQ9NY46 2000 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0G2JMP0 313 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0X1KG70 313 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CIB4A0PJX0 185 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 LRRN3E7EW58 273 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 PSMD9O00233 223 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 PIP5K1CO60331 668 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ZG16O60844 167 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 PAHP00439 452 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 UMODP07911 640 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CELA2AP08217 269 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 GABRA1P14867 456 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 NAT1P18440 290 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 EDNRAP25101 427 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ETV1P50549 477 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CCR6P51684 374 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ST3GAL3Q11203 375 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 RPTNQ6XPR3 784 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 NRMQ8IXM6 262 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 SRRQ9GZT4 340 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms