RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466165.1

PRKRA-208, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, human

TSL 2

Gene PRKRA, Length 585 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKRA-208	ENST00000466165	MOG	Q16653	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKRA-208	ENST00000466165	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165		M0R3G1	203 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	PIN1P1	O15428	100 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	CLPTM1	O96005	669 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	MT-ND5	P03915	603 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	GIPR	P48546	466 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	TAF9	Q16594	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	CCL17	Q92583	94 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	EMCN	Q9ULC0	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165		A0A096LPI6	279 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	NDUFA7	O95182	113 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	AHSA1	O95433	338 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	NGF	P01138	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	IGHM	P01871	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	PNMT	P11086	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF250	P15622	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF12	P17014	697 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	COPZ1	P61923	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	FUT5	Q11128	374 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	KANK2	Q63ZY3	851 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	CADM2	Q8N3J6	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	DPY30	Q9C005	99 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	PEX11A	O75192	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	UBL3	O95164	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SELE	P16581	610 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	IL7R	P16871	459 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	RAB39A	Q14964	217 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	NPIPB7	O75200	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	SERPINA5	P05154	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	LCK	P06239	509 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	UQCRC2	P22695	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165		Q6ZPA2	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	LRR1	Q96L50	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRKRA-208	ENST00000466165	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms