RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM156Q8N614 296 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MDS2Q8NDY4 140 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HAS2Q92819 552 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ART5Q96L15 291 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAGEB18Q96M61 343 aa7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF639Q9UID6 485 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF150Q9ULK6 438 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNK1Q13470 666 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEBPEQ15744 281 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR73Q6P4I2 378 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPGNQ6UW88 154 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRHL3Q8TE85 626 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HPF1Q9NWY4 346 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM30A4D0T7 59 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf51A8MQB3 221 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFLARO15519 480 aa7.5□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPGP29372 298 aa7.5□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNASE1L1P49184 302 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENTPD1P49961 510 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLDN8P56748 225 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD81P60033 236 aa7.5□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.5□□□□□ -1.21
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIAH3Q8IW03 269 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR8K3Q8NH51 312 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUBPLQ8TB37 319 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF675Q8TD23 568 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIK3R3Q92569 461 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMBIM1Q969X1 311 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf21Q9H246 121 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MED4Q9NPJ6 270 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
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