RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443509.6

PRUNE2-208, Transcript of prune homolog 2, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PRUNE2, Length 12,356 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRUNE2-208	ENST00000443509	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	BANF2	Q9H503	90 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	RAD51D	O75771	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF44	P15621	663 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	FPR3	P25089	353 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	S100A7	P31151	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCR6	P51684	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	HSD11B2	P80365	405 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CXCL10	P02778	98 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PRKACG	P22612	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GIF	P27352	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	AQP2	P41181	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GRM7	Q14831	915 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	MPPED2	Q15777	294 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PLK5	Q496M5	336 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	RBP7	Q96R05	134 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	POM121B	A6NF01	834 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509		H7BY64	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SGK494	L7N484	410 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ACOT8	O14734	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SNCG	O76070	127 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCR9	P51686	369 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM3C	Q92520	227 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GBA	P04062	536 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GP1BB	P13224	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCL5	P13501	91 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GABRR1	P24046	479 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ACVRL1	P37023	503 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GPM6B	Q13491	265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PITX2	Q99697	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	C1orf105	O95561	183 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	IL33	O95760	270 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	PCCB	P05166	539 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	NT5E	P21589	574 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ABCD3	P28288	659 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRUNE2-208	ENST00000443509	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 209.9 ms