RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZNF529Q6P280 563 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TMEM25Q86YD3 366 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR6T1Q8NGN1 323 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 INTS14Q96SY0 518 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ETV7Q9Y603 341 aa5.9□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 D6RAR5 112 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 C11orf98E9PRG8 122 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 IGLV3-27P01718 113 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SLC6A12P48065 614 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PRLHRP49683 370 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CSRP3P50461 194 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TAS2R46P59540 309 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ID2Q02363 134 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ZNF616Q08AN1 781 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MBTPS1Q14703 1052 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 KIAA0040Q15053 153 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PHF19Q5T6S3 580 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 USP53Q70EK8 1073 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MISPQ8IVT2 679 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SVBPQ8N300 66 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GDE1Q9NZC3 331 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 HCSTQ9UBK5 93 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 RARRES3Q9UL19 164 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MCM3APO60318 1980 aa5.9□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ARPC5O15511 151 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SIGLEC6O43699 453 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TRAPPC6AO75865 159 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 C1orf105O95561 183 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MT-ND4P03905 459 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ZNF43P17038 809 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GALP22466 123 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SLC7A9P82251 487 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 RUNX3Q13761 415 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ODF4Q2M2E3 257 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SYT14P1Q58G82 188 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 HBMQ6B0K9 141 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 AWAT2Q6E213 333 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GAREM2Q75VX8 874 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ZNF596Q8TC21 504 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MALSU1Q96EH3 234 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR1F2PQ96R84 312 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 DPH1Q9BZG8 443 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LDAHQ9H6V9 325 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 C12orf49Q9H741 205 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 NINQ8N4C6 2090 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 A0A0J9YY10 115 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SOX15O60248 233 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 UBL3O95164 117 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR4E1P0C645 316 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 STAG3L3P0CL85 134 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 FUT1P19526 365 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 KIR2DL3P43628 341 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PCBD1P61457 104 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 BTG1P62324 171 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GPR50Q13585 617 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MPEG1Q2M385 716 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR4K13Q8NH42 304 aa5.89□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ASB13Q8WXK3 278 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms