RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ZFAND5O76080 213 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GLCEO94923 617 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PTNP21246 168 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TNFSF8P32971 234 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SDC2P34741 201 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 BLVRAP53004 296 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 EGR4Q05215 589 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CDC20Q12834 499 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 DDI2Q5TDH0 399 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MZT2AQ6P582 158 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM99Q8N816 258 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR4K13Q8NH42 304 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SETD6Q8TBK2 473 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GPR119Q8TDV5 335 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 RNF138Q8WVD3 245 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ST8SIA1Q92185 356 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM203Q969S6 136 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TAAR9Q96RI9 348 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TIMP4Q99727 224 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ETAA1Q9NY74 926 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CMAHPQ9Y471 501 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 GABRPO00591 440 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 CTDSP2O14595 271 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 CASKO14936 926 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 OGG1O15527 345 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 PTTG1O95997 202 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 LALBAP00709 142 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 BGLAPP02818 100 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 SPI1P17947 270 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 MST1P26927 711 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 AQP2P41181 271 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 CTXN1P60606 82 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 PPP3R1P63098 170 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ERVK-25P63136 954 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 MC2RQ01718 297 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF85Q03923 595 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ATP1A4Q13733 1029 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 QPRTQ15274 297 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 SGCBQ16585 318 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 CDONQ4KMG0 1287 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 SLC6A19Q695T7 634 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 FAAH2Q6GMR7 532 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 FAM122BQ7Z309 247 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 PRR22Q8IZ63 422 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T4Q8NH00 348 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 NKD1Q969G9 470 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 SPSB2Q99619 263 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 TM9SF2Q99805 663 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 CTRCQ99895 268 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 MFRPQ9BY79 579 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.07□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.07□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.07□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.07□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 CDC14CA4D256 554 aa9.07□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 OR6C68A6NDL8 312 aa9.07□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 HSPB2A8KAH6 182 aa9.07□□□□□ -0.96
POLR1A-204ENST00000424089 B4E171 279 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms