RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392244.7

SUMO1-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1-201ENST00000392244 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 STARD4Q96DR4 205 aa14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 UCK2Q9BZX2 261 aa14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PIGMQ9H3S5 423 aa14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 IL20Q9NYY1 176 aa14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 A0A1W2PRG6 482 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 MCIDASD6RGH6 385 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SERPINI2O75830 405 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CGAP01215 116 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CD14P08571 375 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CD8BP10966 210 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 AGAP20933 346 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 BMP5P22003 454 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 NTF4P34130 210 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CLDN17P56750 224 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CTXN1P60606 82 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PPP2R2BQ00005 443 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RFX4Q33E94 735 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 AAED1Q7RTV5 226 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 KIF18BQ86Y91 864 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CIB1Q99828 191 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PROCRQ9UNN8 238 aa14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PDLIM1O00151 329 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 MGRN1O60291 552 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ZG16O60844 167 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ZNF432O94892 652 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 OSMP13725 252 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 IFNGR1P15260 489 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SLC6A6P31641 620 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 OR3A2P47893 321 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RIPK1Q13546 671 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ACKR1Q16570 336 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 XKRXQ6PP77 449 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CASP12Q6UXS9 341 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PARP8Q8N3A8 854 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 APH1AQ96BI3 265 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 TXNDC15Q96J42 360 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SAMD8Q96LT4 415 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 C12orf49Q9H741 205 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 KRT84Q9NSB2 600 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 MED29Q9NX70 200 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 USE1Q9NZ43 259 aa14.73□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SLC35F4A4IF30 521 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 MSTNO14793 375 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SOX14O95416 240 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 BCL10O95999 233 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SELENOPP49908 381 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 BIDP55957 195 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 DAG1Q14118 895 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 MELKQ14680 651 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 NIPAL3Q6P499 406 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 FAM122BQ7Z309 247 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.72□□□□□ -0.05
SUMO1-201ENST00000392244 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms