RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 CHP2O43745 196 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 CRLF1O75462 422 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 OR6A2O95222 327 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 C8BP07358 591 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 SLC25A16P16260 332 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 PCGF2P35227 344 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 SERPINF1P36955 418 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 ENTPD8Q5MY95 495 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 METTL21CQ5VZV1 264 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 OR10H5Q8NGA6 315 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 OR6T1Q8NGN1 323 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 OR6N1Q8NGY5 312 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 SEC61A2Q9H9S3 476 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 JMJD1CQ15652 2540 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 C11orf98E9PRG8 122 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 LY6HO94772 140 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 MT-ATP6P00846 226 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 CELA3BP08861 270 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 MMEL1Q495T6 779 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 ULBP2Q9BZM5 246 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 USP22Q9UPT9 525 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 ABCA1O95477 2261 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-202ENST00000378546 SLC35F4A4IF30 521 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 IGKV3-15P01624 115 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 IGLV1-44P01699 117 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 OR4A8P0C604 315 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 ADORA3P0DMS8 318 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CBR1P16152 277 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CD247P20963 164 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CALCRP30988 508 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 ARR3P36575 388 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CAMK2DQ13557 499 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CARTPTQ16568 116 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 MDP1Q86V88 176 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SNX32Q86XE0 403 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 FAM169BQ8N8A8 192 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 OR4F15Q8NGB8 312 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 OR5J2Q8NH18 312 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 TAMM41Q96BW9 452 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 VSTM5A8MXK1 200 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 GPRIN2O60269 458 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SASH3O75995 380 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.137e-7■■■□□ 18.1
FAAP20-202ENST00000378546 NPTX1Q15818 432 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SWI5Q1ZZU3 235 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 VMACQ2NL98 169 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 TXNDC15Q96J42 360 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SH3GL1Q99961 368 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 MRGBPQ9NV56 204 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 B9A039 149 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 PLPP3O14495 311 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 PDE5AO76074 875 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CH25HO95992 272 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 F12P00748 615 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 UMPSP11172 480 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 CD79AP11912 226 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 ADIPOQQ15848 244 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 MST1LQ2TV78 715 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 PXKQ7Z7A4 578 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 C10orf105Q8TEF2 133 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 PROX1Q92786 737 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SORCS2Q96PQ0 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 ECSITQ9BQ95 431 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 SONP18583 2426 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 A8MV72 311 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 FBP2O00757 339 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-202ENST00000378546 B4GALT1P15291 398 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms