RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
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RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf220Q5T0J3 134 aa1.62□□□□□ -2.15
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC23Q5W5X9 447 aa1.62□□□□□ -2.15
RNU6-552P-201ENST00000362869 H2AFVQ71UI9 128 aa1.62□□□□□ -2.15
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RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX19O60806 448 aa1.61□□□□□ -2.15
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DMRTC1Q5HYR2 192 aa1.61□□□□□ -2.15
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RNU6-552P-201ENST00000362869 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC58Q96CX6 371 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf40BQ96DE9 158 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D31Q96DN5 1066 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-552P-201ENST00000362869 DTNBP1Q96EV8 351 aa1.6□□□□□ -2.15
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RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM10Q96HG1 83 aa1.6□□□□□ -2.15
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