RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ARL4DP49703 201 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX261Q6UWH6 196 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM71CQ8NEG0 241 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF671Q8TAW3 534 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM4Q8WVI0 70 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 HGDQ93099 445 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 U3KQ87 197 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TRABD2BA6NFA1 517 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR32B1ATL7 298 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CLPSP04118 112 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CCR6P51684 374 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 BTN2A1Q7KYR7 527 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF440Q8IYI8 595 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR22Q8IZ63 422 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6C4Q8NGE1 309 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF749O43361 778 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TSC22D2O75157 780 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 NUDT1P36639 197 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 DYRK1AQ13627 763 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ORAI1Q96D31 301 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 Q96M85 177 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF281Q9Y2X9 895 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GTQ1 180 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PATE3B3GLJ2 98 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A5O76082 557 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYZL1O95825 349 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 IGF2P01344 180 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ADRB1P08588 477 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ELMOD2Q8IZ81 293 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPHQ8WWY8 451 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG12Q9BV10 488 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 HIF3AQ9Y2N7 669 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQ72 361 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TLCD2A6NGC4 264 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 RAF1P04049 648 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TPOP07202 933 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 AQP2P41181 271 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM69BQ5VUD6 431 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LEG1Q6P5S2 330 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM122BQ7Z309 247 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF680Q8NEM1 530 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1L3Q8NH93 324 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8D2Q9GZM6 311 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PLCL2Q9UPR0 1127 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00862A6NCI5 91 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 IFITM5A6NNB3 132 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 C4orf47A7E2U8 309 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMD9O00233 223 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR171O14626 319 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFPL1O95159 310 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MT-ND4P03905 459 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SULT1A3P0DMM9 295 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SULT1A4P0DMN0 295 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCRC1P31930 480 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ADH7P40394 386 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 HSD17B7P56937 341 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF74Q16587 644 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ST3GAL2Q16842 350 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOA3BQ3SY89 546 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 WBP2NLQ6ICG8 309 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 IZUMO1Q8IYV9 350 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 EXD3Q8N9H8 876 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC75AQ8NAA5 344 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOA3Q8NG57 546 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF285Q96NJ3 590 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SORCS2Q96PQ0 1159 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTR6Q9GZN1 396 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 AUNIPQ9H7T9 357 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 RABL2BQ9UNT1 228 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FER1L5A0AVI2 2057 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOD1A6NK06 481 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM171A2A8MVW0 826 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 AIPO00170 330 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GRK6P43250 576 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A1P53007 311 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMK2DQ13557 499 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SHBQ15464 509 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SIGIRRQ6IA17 410 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms