RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM25AB3EWG3 89 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM25CB3EWG5 89 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM25GB3EWG6 89 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 WWP2O00308 870 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN4O14493 209 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF13O43567 381 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IDH3BO43837 385 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FCMRO60667 390 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CH25HO95992 272 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ADRA2AP08913 450 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PRG2P13727 222 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SPNP16150 400 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK2P20151 261 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DRD5P21918 477 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DMAP28067 261 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NOS3P29474 1203 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRA3P34903 492 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DDOSTP39656 456 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 EVX1P49640 407 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TDGF1P3P51864 188 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF136P52737 540 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTA2P62736 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTG2P63267 376 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HSD11B2P80365 405 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FABP5Q01469 135 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 STX4Q12846 297 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP4K2Q12851 820 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IL18Q14116 193 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ8Q15842 424 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP69Q49AA0 526 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPAL3Q6P499 406 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PLET1Q6UQ28 207 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GFRALQ6UXV0 394 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RDH10Q8IZV5 341 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CA13Q8N1Q1 262 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8N402 240 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PHYHIPQ92561 330 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NACC2Q96BF6 587 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf79Q96F83 325 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG8Q9BVK2 526 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TMED9Q9BVK6 235 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF121Q9H920 327 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9N2J8 555 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TIGARQ9NQ88 270 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MEIOCA2RUB1 952 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5K3A6NET4 321 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TLCD2A6NGC4 264 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C9J4A7 227 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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SMARCE1-201ENST00000264640 BHLHE40O14503 412 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMARCE1-201ENST00000264640 P2RX6O15547 441 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ORC5O43913 435 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF17O60258 216 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PIP5K1CO60331 668 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF2O60811 474 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSVO60911 334 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB2O95178 105 aa6.38□□□□□ -1.39
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