RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617875.4

RECQL4-209, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RECQL4, Length 3,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.7□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FITM1A5D6W6 292 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CCSO14618 274 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GMDSO60547 372 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FUT5Q11128 374 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 VASNQ6EMK4 673 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TEX19Q8NA77 164 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 H7C2Y5 167 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 UBL3O95164 117 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CTSBP07858 339 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LIPNQ5VXI9 398 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ACBD4Q8NC06 268 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ST8SIA4Q92187 359 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 HSD17B8Q92506 261 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 IFT46Q9NQC8 304 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 COPZ2Q9P299 210 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 S100A6P06703 90 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SLC2A1P11166 492 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PSMA3P25788 255 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 MED25Q71SY5 747 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR2T4Q8NH00 348 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 BPTFQ12830 3046 aa14.69□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF432O94892 652 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SELENOPP49908 381 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ULK3Q6PHR2 472 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SFXN5Q8TD22 340 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PTP4A1Q93096 173 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ROS1P08922 2347 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SPINT1O43278 529 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GP1BBP13224 206 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GPR143P51810 404 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 MEP1BQ16820 701 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 MARCH3Q86UD3 253 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 OR52N1Q8NH53 320 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PPA2Q9H2U2 334 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CA14Q9ULX7 337 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SYT5O00445 386 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 HTR2AP28223 471 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SFTPDP35247 375 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 MAP2K6P52564 334 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 GUCA2AQ02747 115 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 AANATQ16613 207 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 CORO6Q6QEF8 472 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 HDAC8Q9BY41 377 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 IL20Q9NYY1 176 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 KCND3Q9UK17 655 aa14.68□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 SRMP19623 302 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TACR3P29371 465 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ACTA2P62736 377 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 ACTG2P63267 376 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 NFATC4Q14934 902 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RECQL4-209ENST00000617875 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms