RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	NTRK2	Q16620	822 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	LIPN	Q5VXI9	398 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	LINC00471	Q8N535	108 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	MYADM	Q96S97	322 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	BCO1	Q9HAY6	547 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	CAPN10	Q9HC96	672 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NUDT19	A8MXV4	375 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GPR37	O15354	613 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PLA2G10	O15496	165 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CD37	P11049	281 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ACP2	P11117	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	KCNJ3	P48549	501 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	C18orf63	Q68DL7	685 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CDK20	Q8IZL9	346 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	BMF	Q96LC9	184 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OR7D2	Q96RA2	312 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	S100A13	Q99584	98 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RHCG	Q9UBD6	479 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GLOD5	A6NK44	160 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	REM1	O75628	298 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TOX	O94900	526 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	THBS1	P07996	1170 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	BTC	P35070	178 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GIPR	P48546	466 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GNG10	P50151	68 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NUDT6	P53370	316 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	BDH1	Q02338	343 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TSPAN31	Q12999	210 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	AGRP	O00253	132 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CTSV	O60911	334 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LDB3	O75112	727 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LY86	O95711	162 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TNF	P01375	233 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	DRD1	P21728	446 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CALCR	P30988	508 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	S100A11	P31949	105 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RFX3	P48380	749 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PITPNA	Q00169	270 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FOXK2	Q01167	660 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OR7G2	Q8NG99	324 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	HMGB4	Q8WW32	186 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FGF14	Q92915	247 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RBP7	Q96R05	134 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RERGL	Q9H628	205 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LRRTM2	O43300	516 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FMO6P	O60774	539 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	UBXN7	O94888	489 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FGF2	P09038	288 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ARL4D	P49703	201 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PKIA	P61925	76 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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