RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ARL6IP5O75915 188 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 EPPINO95925 133 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 HBQ1P09105 142 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 TACSTD2P09758 323 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OR2T7P0C7T2 308 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 LIMS3P0CW19 117 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 LIMS4P0CW20 117 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 C8orf89P0DMQ9 161 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PNMTP11086 282 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 IFI30P13284 250 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 MAGP20916 626 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 S100A1P23297 94 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 MYL9P24844 172 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 HLA-DMAP28067 261 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 GABRA3P34903 492 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 SOX3P41225 446 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 MAP3K8P41279 467 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 EVX1P49640 407 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PDX1P52945 283 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 LBX1P52954 281 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 BLVRAP53004 296 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OR2B6P58173 313 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PRPS1P60891 318 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 DCAF7P61962 342 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ACTA2P62736 377 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ACTG2P63267 376 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 IFITM3Q01628 133 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 FUT5Q11128 374 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 DNASE1L3Q13609 305 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 GPR18Q14330 331 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 GALEQ14376 348 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PON3Q15166 354 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 SHHQ15465 462 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OR1Q1Q15612 314 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 GPR68Q15743 365 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF141Q15928 474 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 DUSP5Q16690 384 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ALG11Q2TAA5 492 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC58Q4VC31 144 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 FHL5Q5TD97 284 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 AGAP6Q5VW22 663 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 TRIQKQ629K1 86 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 FCRL6Q6DN72 434 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PLET1Q6UQ28 207 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF836Q6ZNA1 936 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OAFQ86UD1 273 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 GKN2Q86XP6 184 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 VRK2Q86Y07 508 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 CPOQ8IVL8 374 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 NRMQ8IXM6 262 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF527Q8NB42 609 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OR7G2Q8NG99 324 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 OR2T27Q8NH04 317 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 CDS1Q92903 461 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 RIT1Q92963 219 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 AGAP4Q96P64 663 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 TEAD3Q99594 435 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 TTYH2Q9BSA4 534 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 AICDAQ9GZX7 198 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 RAB33BQ9H082 229 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 C12orf10Q9HB07 376 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 Q9N2J8 555 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 EQTNQ9NQ60 294 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 CMC2Q9NRP2 79 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRM-215ENST00000583289 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
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