RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568566.5

TSC2-223, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 3

Gene TSC2, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-223	ENST00000568566	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	TXNDC15	Q96J42	360 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	RNF122	Q9H9V4	155 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	SELENON	Q9NZV5	590 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	PRSS50	Q9UI38	385 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TSC2-223	ENST00000568566	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.23	1e-7	■■□□□ 13.9
TSC2-223	ENST00000568566		A8MXE2	369 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	CHP2	O43745	196 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	CYTIP	O60759	359 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	OR5F1	O95221	314 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	AHSA1	O95433	338 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	SYNGR4	O95473	234 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	PMS2P2	O95744	297 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	IFNA14	P01570	189 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	IGHV3-9	P01782	118 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	IFNW1	P05000	195 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	IDUA	P35475	653 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	UGT2B10	P36537	528 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	CD79B	P40259	229 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	HTR3A	P46098	478 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	RAC3	P60763	192 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	RNF128	Q8TEB7	428 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	LZIC	Q8WZA0	190 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	DDIT4L	Q96D03	193 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	PRRC1	Q96M27	445 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	PSD2	Q9BQI7	771 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF175	Q9Y473	711 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	ANK2	Q01484	3957 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	AQP7P3	A6NL99	342 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	RNF223	E7ERA6	249 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	C11orf98	E9PRG8	122 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	CDC42EP2	O14613	210 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	MSTN	O14793	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	SERPINI2	O75830	405 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	UQCRB	P14927	111 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	AGTR1	P30556	359 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	AQP2	P41181	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	GPR4	P46093	362 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	ATP5J2	P56134	94 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	SLC35A1	P78382	337 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TNK1	Q13470	666 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	FLOT2	Q14254	428 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF74	Q16587	644 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	SPATS1	Q496A3	300 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	LINGO2	Q7L985	606 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	SPATA24	Q86W54	205 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	NRM	Q8IXM6	262 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM239	Q8WW34	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	ASB9	Q96DX5	294 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	EMC6	Q9BV81	110 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	CHID1	Q9BWS9	393 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	HHATL	Q9HCP6	504 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TSC2-223	ENST00000568566	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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