RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RADIL	Q96JH8	1075 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GFI1	Q99684	422 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CD207	Q9UJ71	328 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559		H0YIG0	161 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF432	O94892	652 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IL33	O95760	270 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TGM6	O95932	706 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TPO	P07202	933 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	OR3A3	P47888	321 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CTXN1	P60606	82 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SKP2	Q13309	424 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TCTE1	Q5JU00	501 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	FCRLA	Q7L513	359 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TIGD4	Q8IY51	512 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	EXD3	Q8N9H8	876 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T4	Q8NH00	348 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K3	Q99759	626 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf10	Q9HB07	376 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RCE1	Q9Y256	329 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		16.78	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF264	O43296	627 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TSC22D2	O75157	780 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PPIC	P45877	212 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CCR4	P51679	360 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RAB30	Q15771	203 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TEX261	Q6UWH6	196 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD1	Q8N878	549 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF511	Q8NB15	262 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf50	Q8WW18	174 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	NSMAF	Q92636	917 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CITED4	Q96RK1	184 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	UCK1	Q9HA47	277 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559		U3KQ87	197 aa		16.77	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SPTB	P11277	2137 aa		16.77	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM72	A0PK05	275 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf105	B2RV13	164 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	IDS	B3KWA1	339 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CLPS	P04118	112 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PROS1	P07225	676 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GRPR	P30550	384 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	UQCRC1	P31930	480 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MNDA	P41218	407 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FASLG	P48023	281 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SCAND1	P57086	179 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LIPN	Q5VXI9	398 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LYPD8	Q6UX82	237 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR52I2	Q8NH67	350 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC61	Q9BV99	259 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	NPTN	Q9Y639	398 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM131	Q92545	1883 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HSPB2	A8KAH6	182 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD9	O00233	223 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	UPK3A	O75631	287 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	RAF1	P04049	648 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2AB	P04908	130 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ADRB1	P08588	477 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ART1	P52961	327 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	IKZF1	Q13422	519 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK2D	Q13557	499 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CCIN	Q13939	588 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CD226	Q15762	336 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HSPB2	Q16082	182 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MTFR2	Q6P444	385 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CDC20B	Q86Y33	519 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GATS	Q8NAP1	163 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		16.76	■□□□□ 0.27

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