RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551157.6

TARBP2-216, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 1,008 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-216	ENST00000551157	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157		A0A1B0GWA3	101 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	WNT9B	O14905	357 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	KRT33A	O76009	404 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	GRPR	P30550	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	EFNB3	Q15768	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HDX	Q7Z353	690 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157		A0A0G2JPF8	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157		B9A039	149 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	CLIC1	O00299	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	AHSA1	O95433	338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	TGFA	P01135	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HLA-H	P01893	362 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	CRYAA	P02489	173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	BMP2	P12643	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	CBR1	P16152	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	ZNF23	P17027	643 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	SRD5A1	P18405	259 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	GZMK	P49863	264 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	COPZ1	P61923	177 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	NPRL3	Q12980	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	CR1L	Q2VPA4	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	LRP11	Q86VZ4	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	EBF4	Q9BQW3	602 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	PIF1	Q9H611	641 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	MED29	Q9NX70	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157		M0R3G1	203 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	BGLAP	P02818	100 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	THY1	P04216	161 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	CSF3	P09919	207 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	DAO	P14920	347 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	PPOX	P50336	477 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	SEC24C	P53992	1094 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	FADD	Q13158	208 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TARBP2-216	ENST00000551157	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms